En 2025, choisir le bon logiciel de comptabilité est devenu un enjeu stratégique pour les entreprises françaises. Face à la multiplication des solutions disponibles sur le marché, il est parfois difficile de s’y retrouver. Notre comparatif vous aide à identifier les meilleures options adaptées à vos besoins spécifiques, qu’il s’agisse de solutions gratuites ou payantes, pour auto-entrepreneurs, PME ou associations.

Les critères à prendre en compte pour choisir son logiciel de comptabilité

La sélection d’un logiciel comptable adapté nécessite une analyse approfondie de plusieurs facteurs essentiels. Les entreprises doivent évaluer non seulement les fonctionnalités proposées mais également la simplicité d’utilisation et la compatibilité avec leur structure. Le logiciel memsoft s’est imposé comme une référence dans ce domaine grâce à son approche équilibrée entre richesse fonctionnelle et accessibilité. Cette solution propose des options évolutives qui s’adaptent aux besoins des TPE et PME, avec une offre allant de versions gratuites pour les petites structures à des solutions plus complètes pour les entreprises en croissance.

La facilité d’utilisation et l’interface utilisateur

L’ergonomie constitue un critère déterminant dans le choix d’un logiciel comptable. Une interface intuitive permet de gagner un temps précieux dans la gestion quotidienne et facilite la prise en main par les collaborateurs. Les solutions comme Abby ou Henrri sont reconnues pour leur simplicité, ce qui les rend particulièrement adaptées aux auto-entrepreneurs. À l’opposé, des logiciels comme Dolibarr, malgré leurs nombreuses fonctionnalités, peuvent rebuter certains utilisateurs par leur interface datée et leur configuration complexe. Memsoft se distingue avec une interface moderne et intuitive, offrant un excellent compromis entre richesse fonctionnelle et facilité d’utilisation, comme en témoigne sa note de satisfaction de 4.54/5 basée sur 73 avis d’utilisateurs.

Les fonctionnalités et la compatibilité avec les normes françaises

Les fonctionnalités essentielles d’un logiciel de comptabilité incluent l’import/export de données, la gestion des journaux comptables, le rapprochement bancaire, la facturation et le suivi des dépenses. La conformité aux normes comptables et fiscales françaises est également cruciale. Des logiciels comme Sage ou Cegid sont réputés pour leur robustesse et leur adaptation aux réglementations, mais peuvent s’avérer complexes pour les petites structures. Oxyg 11 de Memsoft se démarque par sa conformité aux normes françaises tout en proposant des mises à jour régulières qui intègrent les dernières réformes, comme en témoignent les récentes versions incluant les réformes de la paie de mai 2025 et la normalisation des factures de service à la personne.

Comparatif logiciel de comptabilité en 2025 en France

Memsoft face à ses concurrents sur le marché français

En 2025, le marché des logiciels comptables en France est particulièrement concurrentiel. On y trouve des solutions diverses comme Sage (à partir de 18€/mois), Cegid (sur devis), EBP (à partir de 28€/mois), ou encore Pennylane (à partir de 29€/mois). Face à ces acteurs établis, Memsoft a su se forger une place de choix grâce à son approche centrée sur les besoins spécifiques des entreprises françaises et son excellent rapport qualité-prix.

Les avantages qui placent Memsoft en tête du classement

Memsoft se distingue par son offre complète et modulaire qui couvre l’ensemble des besoins de gestion d’une entreprise : comptabilité, gestion commerciale, CRM et paie. Sa flexibilité est un atout majeur, avec des solutions gratuites pour les petites structures et des versions plus élaborées pour les entreprises en croissance. Contrairement à des logiciels comme Wave qui offrent les bases mais sont limités en synchronisation bancaire, ou Indy qui se concentre uniquement sur les micro-entrepreneurs, Memsoft propose une solution évolutive qui s’adapte à la croissance de l’entreprise. Ses services associés constituent également un avantage compétitif significatif : support technique, formation, migration depuis d’autres logiciels, télédéclaration des liasses fiscales, TVA et DSN, ainsi que la génération automatique d’écritures comptables.

Les avis des utilisateurs et professionnels sur Memsoft

La satisfaction des utilisateurs est un indicateur fiable de la qualité d’un logiciel. Avec une note de 4.54/5 calculée sur 73 avis, Memsoft bénéficie d’une excellente réputation auprès de ses utilisateurs. Les professionnels apprécient particulièrement sa capacité à s’adapter à différents secteurs d’activité grâce à des solutions métiers personnalisables. Les mises à jour régulières, comme les récentes versions d’Oxygène (11.04.36 et 11.04.26) en 2025, témoignent de l’engagement de l’éditeur à maintenir son logiciel en conformité avec les dernières évolutions réglementaires et technologiques. Cette réactivité est particulièrement valorisée par les utilisateurs qui doivent s’adapter rapidement aux changements législatifs en matière comptable et fiscale.

Top 8 Meilleurs logiciels de comptabilité 2025

  1. Memsoft Oxygène
  2. Tiime
  3. Pennylane
  4. Regate
  5. Indy
  6. Axonaut
  7. FreshBooks
  8. iTool

Memsoft Oxygène

Memsoft Oxygène s’impose comme la solution de référence pour les TPE et PME françaises en 2025. Créée en 1998, cette société française propose une suite logicielle complète couvrant la comptabilité, la gestion commerciale, le CRM et la paie. Son principal atout réside dans son modèle économique innovant qui offre des versions gratuites pour la comptabilité, la gestion commerciale, le CRM et même la paie (jusqu’à 10 bulletins par mois). Cette gratuité permet aux jeunes entreprises de démarrer sans investissement initial, tout en bénéficiant d’une solution évolutive qui accompagne leur croissance. Avec un chiffre d’affaires de 1,34 M€ en 2025 (en croissance de 10,2%) et une note de 4.60/5 basée sur 68 avis récents, Memsoft Oxygène démontre sa solidité financière et la satisfaction de ses utilisateurs. Le logiciel se distingue par sa conformité aux normes françaises (BOI DGFIP FEC DSN), ses mises à jour régulières intégrant les dernières réformes fiscales et sociales, et son service de télédéclaration des liasses fiscales, de la TVA et de la DSN. Son support technique réactif et son excellent rapport qualité-prix en font le choix privilégié des professionnels recherchant une solution française fiable et complète.

Tiime

Tiime s’est imposé comme le logiciel « n°1 des entrepreneurs » en France grâce à son approche tout-en-un simplifiée. Cette solution 100% Made in France, notée 4,8/5 sur plus de 4 700 avis, séduit par sa capacité à centraliser facturation, comptabilité, gestion des dépenses et trésorerie sur une seule plateforme intuitive. Son compte professionnel intégré (Tiime Business) avec IBAN français et carte Mastercard constitue un avantage majeur pour les entrepreneurs souhaitant unifier leur gestion financière. La synchronisation automatique avec plus de 200 banques et le rapprochement bancaire automatisé permettent un gain de temps considérable dans la gestion quotidienne. Tiime se démarque également par son agrément pour la facturation électronique, préparant ainsi les entreprises à la réforme de 2026. Avec une offre gratuite pour la création et l’envoi de factures, et des formules payantes à partir de 17,99€ HT/mois, Tiime offre un excellent point d’entrée pour les auto-entrepreneurs et TPE. Son service client basé en France (Paris et Lorraine) et son interfaçage en temps réel avec les experts-comptables renforcent sa position de solution collaborative et accessible.

Pennylane

Pennylane représente la nouvelle génération de logiciels comptables français. Fondée en 2019 et devenue licorne en février 2024, cette société a levé 75 millions d’euros en avril 2025 spécifiquement pour financer la réforme de la facturation électronique, dont elle est Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP) immatriculée. Utilisée par plus de 500 000 dirigeants et experts-comptables, Pennylane se positionne comme une solution tout-en-un réunissant finances, comptabilité, facturation et compte professionnel. Sa force réside dans sa collaboration native entre dirigeants et cabinets comptables, permettant un travail sur la même plateforme en temps réel. Le module de gestion des dépenses (Spend Management) avec workflows de validation et paiement en 1 clic, associé à une forte automatisation des tâches répétitives, en fait une solution particulièrement performante pour les PME et ETI. Certifiée ISO 27001, Pennylane offre également de nombreuses intégrations avec des outils métiers populaires (Qonto, Payfit, Stripe). Son tableau de bord unique offrant une vision 360° de la santé financière et son positionnement d’acteur innovant du French Tech 120 en font un concurrent sérieux pour les entreprises recherchant modernité et scalabilité.

Regate (by Qonto)

Regate by Qonto se positionne comme un écosystème collaboratif rapprochant cabinets d’expertise comptable et entreprises clientes. Avec plus de 6 000 cabinets et 600 000 entreprises utilisatrices, cette solution se distingue par sa pré-comptabilité automatisée performante, dotée d’un OCR propriétaire affichant un indice de codage proche de 100%. Son intégration native avec les principaux logiciels de production comptable français (Sage Génération Experts, Cegid Quadra, My Unisoft, Cegid Loop, ACD, Agiris) permet aux cabinets d’adopter Regate sans migration de leur outil principal. La plateforme excelle dans la récupération, dématérialisation et association automatique des justificatifs, avec un déversement direct des écritures dans le logiciel comptable. Qonto PDP, solution de facture électronique pré-immatriculée par l’administration fiscale, positionne Regate en avant-garde de la réforme 2026. L’outil gratuit de création d’entreprise en marque blanche (génération de statuts, dépôt de capital en 20 minutes) ajoute une valeur significative pour les cabinets. Notée 4,8/5 sur Trustpilot et 4,8/5 sur G2, Regate séduit par sa productivité accrue et son programme de partenariat rémunérateur pour les experts-comptables, bien que son service client soit limité à 5j/7 (9h-18h).

Indy

Indy s’est spécialisé dans l’accompagnement des travailleurs indépendants avec plus de 200 000 utilisateurs en 2025. Cette solution française (anciennement Georges.tech), fondée en 2016 à Lyon, a récemment remporté un procès en appel contre l’Ordre des experts-comptables, renforçant sa légitimité sur le marché. Indy se démarque par son automatisation poussée grâce à l’IA : synchronisation bancaire automatique, détection de la TVA, classement intelligent des écritures et des reçus. Sa tarification est particulièrement attractive avec une offre Essentiel gratuite (0€/mois) incluant logiciel, compte pro et facturation, bien que les déclarations fiscales ne soient pas prises en charge. Les offres Plus (9€/mois HT) et Premium (12€/mois HT) ajoutent l’automatisation et la télétransmission des déclarations fiscales. Noté 4,8/5 sur Trustpilot avec plus de 9 000 avis, Indy excelle dans l’expérience utilisateur pour les micro-entrepreneurs, entreprises individuelles (BIC/BNC) et petites structures (SAS, SASU, EURL, SARL, SCI). Son compte professionnel intégré avec carte Mastercard et son support réactif (moins de 4 minutes de réponse) renforcent son attractivité, même si la solution reste limitée aux besoins basiques et ne remplace pas un expert-comptable pour des conseils stratégiques approfondis.

Axonaut

Axonaut se distingue par son approche tout-en-un spécialement conçue pour les TPE et PME de moins de 25 salariés gérées en équipe. Cette solution SaaS française, créée par des entrepreneurs pour des entrepreneurs, intègre non seulement la comptabilité et la facturation, mais également un CRM performant et des fonctionnalités RH rares dans cette catégorie (édition de bulletins de paie au format légal, gestion des congés). Avec plus de 189 000 utilisateurs et le label French Tech, Axonaut génère un gain de temps moyen de 2 heures par semaine et permet d’encaisser les factures 3 fois plus vite grâce aux relances automatiques (60% des factures en retard réglées après relance) et au paiement en ligne via Stripe, GoCardless ou PayPal. Sa tarification transparente « tout compris » (à partir de 34,99€ HT/mois sur 3 ans) contraste avec les modèles modulaires complexes de certains concurrents. L’automatisation complète de la pré-comptabilité (rapprochement bancaire, exports personnalisés, accès gratuit pour l’expert-comptable) et son immatriculation pour la facture électronique préparent les entreprises aux évolutions réglementaires. Ses intégrations avec plus de 14 000 outils et son interface moderne en font une solution collaborative idéale pour les entreprises de services et du digital, malgré un manque de profondeur analytique pour les structures plus importantes.

FreshBooks

FreshBooks est un logiciel comptable canadien de renommée internationale, valorisé à plus d’1 milliard de dollars et ayant levé plus de 130 millions de dollars. Destiné principalement aux PME, freelances et solopreneurs, particulièrement en Amérique du Nord et en Europe, FreshBooks propose une solution SaaS accessible à partir de 10,80€/mois avec une promotion fréquente de 50% pendant 6 mois. Noté 4,5/5 sur 4 492 avis (SoftwareAdvice) et recommandé par PCMag.com, le logiciel se distingue par sa facturation professionnelle personnalisable avec paiements en ligne (ACH et carte de crédit), permettant d’être payé deux fois plus vite selon l’éditeur. Son suivi des dépenses via scanner mobile de reçus, l’importation bancaire automatique et la catégorisation intelligente facilitent la gestion quotidienne. FreshBooks offre également des outils de comptabilité en partie double et des rapports financiers puissants, avec un accès facile pour l’expert-comptable. Ses intégrations avec plus de 100 applications (PayPal, Mailchimp, Zapier, Gusto, Square) et son API gratuite renforcent son écosystème. Les utilisateurs rapportent économiser jusqu’à 553 heures par an et 7 000$ en heures facturables. Cependant, le coût croissant avec l’ajout d’utilisateurs et certains problèmes de support client signalés constituent des points de vigilance pour les entreprises en croissance.

iTool

iTool (iTool by EBP) est un pionnier français de la comptabilité en ligne, créé en 2000 et racheté par EBP en 2006. Cette solution SaaS 100% cloud, conforme « Cloud 2015 » selon le Conseil Supérieur de l’Ordre des Experts Comptables, cible principalement les TPE/PME avec plus de 7 000 clients actifs. iTool se caractérise par sa complétude fonctionnelle couvrant comptabilité, gestion commerciale, facturation et calcul/édition des liasses fiscales avec télétransmission EDI. À partir de 24€/mois pour l’offre Business Comptabilité (incluant 6 utilisateurs) et environ 40€/mois pour l’offre combinée Facturation + Comptabilité, iTool propose un tarif compétitif avec un essai gratuit de 30 jours. Les utilisateurs apprécient particulièrement la complétude du catalogue client s’apparentant à un CRM, le support réactif et les ressources de formation (tutoriels, conférences web). Le rapprochement bancaire automatique/manuel, la gestion des balances et la production des documents comptables réglementaires (journaux, grand livre, liasses fiscales IS/IR BIC/BNC) répondent aux besoins standards des PME. Cependant, iTool souffre d’un manque d’automatisation entre modules, d’intégrations natives limitées (API disponible mais technique), de tableaux de bord jugés insuffisants et d’une interface datée. La solution reste néanmoins recommandée pour les professionnels ayant des connaissances comptables, avec des solutions dédiées pour CSE et agents d’assurances.